北京市脐带学造血干细胞库位于北京经济技术开发区（亦庄），建筑面积近万平方米，库容量达到50万份，是全球最大的脐带血造血干细胞库之一。
脐血库大楼共三层，一层是宽敞明亮的大厅和液氮冷藏库，二层是档案库和办公区，三层为干细胞制备和检测实验室。
液氮冷藏库是脐带血长期储存的地方，新购置世界上最先进的MVE液氮罐，是当今世界上单体储量最大的液氮罐，其设计存储量可以达到5000份，该型号的液氮储存罐为我国脐带血库首次进口使用。
脐带血经过制备后，要在程控降温室通过计算机程序逐步降温至-90摄氏度，然后放入-196摄氏度的的液氮中长期保存。
入库保存的每份脐带血都有自己相应的档案，其中包括所有的实验数据以及相关资料。北京市脐带血库拥有可以保存50万份原始档案的数据资料库
脐带血采集后，由北京市脐血库的专职取血员，以专用的取血工具及脐血周转设备，保证将脐带血在24小时内运送到脐带血库。
脐带血制备室的洁净度设置及管理均参照国家GLP实验室洁净标准。初检合格的脐带血在制备室经密度梯度离心，分离并去除红细胞和血浆，留取有核细胞部分。
细菌检测室配备目前世界上公认的灵敏度和自动化程度最高的法国梅里埃细菌培养箱，对每份脐带血标本都进行严格全面的细菌的检测。
造血干细胞培养室将脐带血干细胞进行体外培养以评估其活性和分化能力。
